windows安装mimic医疗数据库

注意：mimic需要硬盘空间120G左右，请预留足够的空间

前置条件：

1
2
3
4
1、安装7z
2、安装postgresql
3、mimic数据包 https://physionet.org/content/mimiciv/2.2/
4、mimic数据生成包：https://github.com/MIT-LCP/mimic-code
1、安装

以mimiciv2.2为例，请确保前置条件已经搞好。

在D盘创建一个数据根目录MIMIC，用于后续的设置，我是直接将相关的数据都放入了MIMIC

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登录到pgsql的shell中

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2、安装命令
  • 1、创建数据库

Drop database if exists mimiciv;

create database mimiciv owner postgres;

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  • 设置默认目录与编码

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在命令行依次执行create、load_7z、constraint、index.sql文件

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若出现permission deny，将所有的”"替换成 “/“

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执行到load_7z.sql导入数据、根据电脑性能，会等待1-2个小时 \i D:/MIMIC/load_7z.sql

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执行\i D:/MIMIC/constraint.sql创建主键

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执行\i D:/MIMIC/index.sql创建索引

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3、查看

hosp

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icu

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